浙江同济科技职业学院（浙江省水利水电干部学校）前身是创建于1959年的浙江电力技工学校和创建于1956年的浙江省水利干部学校。

浙江电力技工学校几经更名停办，1974年7月更名为浙江水电技工学校。

浙江省水利干部学校经历停办合办，1984年5月更名为浙江省水利水电干部学校。

1984年12月，浙江水利职工中等专业学校在浙江省水利水电干部学校内建立。

1996年3月，浙江水电技工学校与浙江省水利水电干部学校、浙江水利职工中等专业学校三校联合办学。

2001年3月，浙江水利职工中等专业学校更名为浙江水利水电学校，并于当年12月被省教育厅命名为省一级重点职业学校。

2003年1月，浙江同济科技职业学院（筹）成立。

2006年4月，经浙江省政府批准，浙江水利水电学校承建浙江同济科技职业学院（筹）。

2007年2月，浙江同济科技职业学院正式成立，与浙江省水利水电干部学校合署办公。浙江水电技工学校撤销。

2012年1月，学院被水利部确定为全国水利高等职业教育示范院校建设单位。